अंतिम उपराष्ट्रपति पद छोड़कर दिल्ली में निजी फार्म हाउस में शिफ्ट होने पर सवाल उठता रहा, क्योंकि उनके लिए सरकारी बंगला मिलने में देर हो रही थी। 21 जुलाई 2025 को उपराष्ट्रपति पद से इस्तीफा देने वाले जगदीप धनखड़ ने अपना सरकारी घर छोड़ने के बाद हाउसिंग एंड अर्बन मिनिस्ट्री में एप्लिकेशन भेजी थी, लेकिन अब तक उसे कोई जवाब नहीं मिला है।